Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的共同点

2021-11-08 03:11:53 来源:
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核仁在结构上通过有助于或消除该在结构上的激活可以控制蛋白质组的功能性和肝细胞身份认定。这些核仁在结构上之中发挥作用特定的组受体翻译后粘贴(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定激活状况就其,并可有助于消除性染色体在结构上的形成,影响蛋白质的传达。为了在肝细胞器时依然保持蛋白质传达服务器端的持续性,决定核仁在结构上的底物特征也并不需要在子代肝细胞之中创设。创设多种不同类DF核仁状况的不可或缺决定因素是组受体PTMs,主要发挥作用于组受体H3和H4的前肢上。因此,在肝细胞器的流程之中,除了DNA蛋白质型物质,性状核小体也并不需要重建,并平均分配到子代肝细胞之中。或许,研究课题断定性状的经典组受体(比如蛋白质型物质忽视的组受体)则会在蛋白质型物质短柄后迅速再次组装。多种不同的研究课题组断定H3K9me3和H3K27me2/3可通过胚胎蛋白质型。然而,这两个组受体粘贴都是与消除性核仁在结构上就其。那么,性状之中的核小体,以及它们携带的组受体PTMs是否都能蛋白质型到子代肝细胞相同的蛋白质座席上呢?来自纽约大学兰戈恩医学之中心的Danny Reinberg大学教授课题组在Cell发表研究课题Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该研究课题断定在DNA蛋白质型物质时,介导与不受消除核仁区域内的核小体分开是多种不同的。不受消除核仁在结构上之中的核小体则会被移往在子代肝细胞相同的蛋白质区域内,而介导DF核仁在结构上之中的核小体的平均分配则是致密和随机的。为研究课题核小体的分开情况下,研究课题者在候选蛋白质座席不可逆转上标组受体H3.1和H3.2,以大鼠体肝细胞骨髓之中核小体在肝细胞器时的变化。简单来说,该步骤通过邻近受体上标技术,借助CRISPR为特定蛋白质座席的H3.1和H3.2带上糖类上标,经ChIP-qPCR检查该糖类上标在基因表达G1期和S期的稀土元素,以反应核小体的分开情况下。若该亚基H3.1和H3.2上的糖类上标在一次肝细胞器后下降一半,陈述该核小体被移往在了两个子代肝细胞的相同蛋白质座席上;若该糖类粘贴马上消失,陈述子代肝细胞并未蛋白质型该蛋白质座席的核小体。研究课题者首先检查了在体肝细胞骨髓之中梦魇传达的Hoxc6, Ebf1, Meis2蛋白质的核小体分开情况下。这些蛋白质座席的核小体糖类技术水平随肝细胞器逐渐差不多,这查看不受消除的蛋白质座席的核小体则会被移往在子代肝细胞的相同方位。这与前人断定的H3K9me3和H3K27me2/3可通过胚胎蛋白质型的自然现象相印证。那么,介导DF核仁区域内的核小体又是如何分开的呢?研究课题者检查了在体肝细胞骨髓之中被介导传达的Ccna2, Nanog和Pou5f1蛋白质,断定该蛋白质座席的糖类上标在肝细胞器后排列成致密状况,稀土元素很高,这查看对于介导DF核仁区域内来说,性状核小体没有直观的平均分配到子代肝细胞附加的蛋白质座席,而是随机平均分配的。愈来愈无聊的是,在抑制体肝细胞骨髓分化时,Hoxc6蛋白质由消除应运而生介导,它的核小体平均分配模式也由直观的同亚基平均分配改为随机平均分配。这陈述性状核小体的局部平均分配,可以反映该核仁区域内的活性状况。总的来说,该研究课题通过CRISPR引导的组受体糖类上标系统,研究课题了核小体在肝细胞器流程之中的平方根,并断定介导与不受消除的核仁区域内的核小体平方根的多种不同。或多或少的是,在基因表达的S期之中,不受消除的核仁区域内的蛋白质型物质要晚于介导DF核仁区域内。这个整整差异色也引发;也核仁的蛋白质型物质速率之比异色核仁。异色核仁相对较慢的蛋白质型物质反应速度可能保证了核小体的直观平均分配,而;也核仁之中的PTMs则由附加的主通气特异性(master regulators)直接上标附加DNA数列,并募兵PTMs酶再次创设。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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