Nat Biotechnol:研究不能重复?可能是HeLa细胞系“变异”了

2022-01-24 01:16:35 来源:
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HeLa细胞核已经在在世界上的许多物理室人才培养了近70年,并且当今被显然是无限供应的不不定的相同细胞核。然而,2月18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新研究课题表明,细胞核在相异物理室中的间假定很大关联功能性,这招致了对细胞核另有研究课题重复功能性的反驳。“我很就让注意到这项研究课题,但在比如说是上我并不感觉到惊异,”斯隆瑞德珊癌症中的心的分子结构博物学家Prasad Jallepalli说是,他没有参加这项研究课题。这并不是HeLa细胞核另有自迈入以来第一次出现多样化的报道:长久以来,其他研究课题工作组也证明了HeLa细胞核表征本体中的间在基因序列和RNA表达的显着关联功能性。这项最新研究课题首次全面分析了各种HeLa表征本体的遗传表征(相异成品的HeLa细胞核另有生活在在世界上的各个物理室),并且首次证明遗传关联功能性导致了酵素表达和表型的不定化。HeLa细胞核“不定了”?在这项研究课题中的,研究课题医务人员从6个国家的13个物理室收集了14份HeLa样本,并在相同的物理室状况下进行人才培养。他们首先量化了基因拷贝数表征,揭示了它们基因组中的间的显着关联功能性。结果发现,HeLa表征本体中的间,除此以外是CCL2和Kyoto表征本体中的间假定着极大的关联功能性。进一步的分析表明,许多这些遗传关联功能性转变成为mRNA产生的不定化,并且在较小程度上转变成为酵素丰度的不定化。研究课题医务人员报告说是,HeLa CCL2和Kyoto细胞核另有的转录组和酵素组谱彼此中的间的关联功能性,就像来自两种相异类型组织的癌细胞核另有中的间的关联功能性一样。HeLa表征本体在人才培养过程中的繁殖飞行速度也相异,一些细胞核群人需要17.5小时才能翻倍,而另一些细胞核在相同的人才培养状况下需要话费有约32小时。它们对芽孢接种的反应会也有所相异:与其他两种例外相对来说是,一种例外对接种的敏感功能性较低,研究课题医务人员将其归因于低水平的酵素复合物,这种酵素复合物在细菌进入细菌细胞核中的起功用。在一项之外的物理中的,研究课题工作组通过人才培养细胞核另有三个月,来检视HeLa表征本体的基因表达确实会随着时长发生不定化。研究课题医务人员纪录了早期细胞核和晚期细胞核中的间基因表达关联功能性大约6%。苏黎世联邦政府理工学院分子结构另有统生物学研究课题所的Ruedi Aebersell教授是该研究课题的合着者,他说是,“即使在同一个物理室中的,这些细胞核的关联功能性和不定化飞行速度也是比较极高的。”他据估计,如果一个研究课题生在项目开始时用HeLa细胞核另有做了一个物理,并在六个月后被建议重复这个物理,他们可能会获得相异的结果。关于研究课题中的的“可复制功能性危机”的讨论大多数比较大的在物理设计、数据分析不足之处的有缺陷,以及作为主要液压因素的所受空气污染或挂有错标签的细胞核另有。但是Aebersell显然,HeLa细胞核另有和癌细胞核另有的生物学关联功能性可能是关键。为什么会“不定”?斯坦福大学的细胞核博物学家Tim Stearns显然有几个可能的状况可以理解为什么细胞核另有在长时长人才培养其会发生不定化。首先,HeLa细胞核是推断基因组不稳定的癌细胞核,因此很可能随时长随机突不定。此外,它们还会在物理室中的所受到各种繁殖状况的影响,这可能会促使细胞核进化出契合的特功能性。例如,他说是,哺乳动物细胞核的人才培养包括将其人才培养到充满一个菌类为止,从菌类中的得来一部分细胞核,然后将它们放在另一个菌类中的繁殖,这一过程特指瓦解。“每个人做这件事的方式都有点相异,”他说是道。最新这些发现,对于人类人才培养细胞核的研究课题结果的理解和重现功能性有一定的含义。Aebersell和他的同事在论文中的重申了几个具本体的框架。首先,研究课题医务人员应该使用癌细胞核另有的早期传代,并确保在同一细胞核另有的相异样本中的重复同一细胞核另有的物理。更重要的是,博物学家应该清楚地报告他们在给定的研究课题中的使用的细胞核另有表征本体。
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